合伙企業(yè)是指由各合伙人訂立合伙協(xié)議，共同出資，共同經(jīng)營，共享有收益，共擔(dān)風(fēng)險，并對企業(yè)債務(wù)承擔(dān)無限連帶責(zé)任的營利性組織，又可分為普通合伙企業(yè)和有限合伙企業(yè)。

1、合伙企業(yè)增值稅

根據(jù)合伙企業(yè)的正常業(yè)務(wù)類型，區(qū)分不同的稅率和征收率正常繳納，正常對外開具增值稅發(fā)票即可，和其他企業(yè)并無不同。

2、合伙企業(yè)所得稅

合伙制企業(yè)本身并不具有法人地位，不屬于企業(yè)所得稅納稅主體，自身并不需要繳納企業(yè)所得稅，由合伙人繳稅。

根據(jù)財稅[2000]91號文，合伙企業(yè)以每一個合伙人為納稅義務(wù)人。

對合伙企業(yè)而言，被穿透的只是所得稅。

對于流轉(zhuǎn)稅而言，合伙企業(yè)仍然是納稅主體。財稅[2016]36號文第一條規(guī)定，“在中華人民共和國境內(nèi)銷售服務(wù)、無形資產(chǎn)或者不動產(chǎn)(以下稱應(yīng)稅行為)的單位和個人，應(yīng)當(dāng)按照本辦法繳納增值稅。”因此合伙企業(yè)屬于增值稅的納稅主體，其生產(chǎn)經(jīng)營所得應(yīng)對照適用稅率繳納增值稅。

從事股權(quán)投資的有限合伙企業(yè)，股權(quán)轉(zhuǎn)讓所得不需要繳納增值稅，但企業(yè)在二級市場出售股票的行為，應(yīng)比照國家稅務(wù)總局2016年第53號公告第五條對限售股買入價格的判定標(biāo)準(zhǔn)，按照“金融商品轉(zhuǎn)讓”品目繳納增值稅。

股息紅利并入生產(chǎn)經(jīng)營所得繳稅

對于合伙企業(yè)取得的生產(chǎn)經(jīng)營所得，財稅[2000]91號文規(guī)定，按照每一納稅年度的收入總額減除成本、費用以及損失后的余額，作為投資者個人的生產(chǎn)經(jīng)營所得，適用5％—35％的五級超額累進(jìn)稅率，計算征收個人所得稅。但對于合伙企業(yè)對外投資取得的股息紅利所得，不并入企業(yè)的收入，應(yīng)作為合伙人取得的股息紅利，單獨納稅。合伙人為自然人，“按‘利息、股息、紅利所得’應(yīng)稅項目計算繳納個人所得稅”（國稅函[2001]84號）；合伙人為法人，取得的股息紅利由于不屬于“居民企業(yè)直接投資于其他居民企業(yè)取得的投資收益”，因此不能享受居民企業(yè)之間的股息紅利免征企業(yè)所得稅政策，應(yīng)并入法人合伙人當(dāng)期應(yīng)納稅所得額，按25%繳納企業(yè)所得稅。

3、合伙人所得稅

對合伙企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營所得和其他所得，應(yīng)按“先分后稅”原則征收所得稅，以每一合伙人為納稅人，分別繳納個人所得稅或企業(yè)所得稅。自然人合伙人繳納個人所得稅，法人或者其他機構(gòu)繳納企業(yè)所得稅。

《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于合伙企業(yè)合伙人所得稅問題的通知》(財稅[2008]159號)規(guī)定合伙企業(yè)以每一個合伙人為納稅義務(wù)人。合伙企業(yè)合伙人是自然人的，繳納個人所得稅;合伙人是法人和其他組織的，繳納企業(yè)所得稅。

有限合伙企業(yè)合伙人：

股東為自然人承擔(dān)個人所得稅：根據(jù)財稅[2000]91號文，合伙企業(yè)比照個人所得稅法的“個體工商戶的生產(chǎn)經(jīng)營所得”應(yīng)稅項目，適用5％—35％的五級超額累進(jìn)稅率計算征收個人所得稅。

備注：執(zhí)行有限合伙企業(yè)合伙事務(wù)的自然人普通合伙人，按“個體工商戶的生產(chǎn)經(jīng)營所得”應(yīng)稅項目，適用5%-35%的五級超額累進(jìn)稅率，計算征收個人所得稅。不執(zhí)行有限合伙企業(yè)合伙事務(wù)的自然人有限合伙人，其從有限合伙企業(yè)取得的股權(quán)投資收益，按“利息、股息、紅利所得”應(yīng)稅項目，依20%稅率計算繳納個人所得稅（以地方執(zhí)行政策為準(zhǔn)）。因此符合條件的有限合伙企業(yè)，自然人有限合伙人可以享受20%優(yōu)惠稅率，自然人普通合伙人，仍然適用五級超額累進(jìn)稅率計算繳納個人所得稅。

股東為企業(yè)承擔(dān)企業(yè)所得稅：合伙人是法人組織的情況，按照企業(yè)所得稅來繳納，適用25%的稅率。

疑點1：如果合伙企業(yè)的利潤留存在企業(yè)，一直不作分配，合伙人需不需要繳稅？

財稅[2008]159號文規(guī)定：“合伙企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營所得和其他所得采取‘先分后稅’的原則”?！跋确趾蠖悺保骸跋确帧笔侵浮皯?yīng)分配”的所得，而不是實際分配的金額。合伙企業(yè)的應(yīng)納稅所得額中不僅包含分配給合伙人的利潤，也包括應(yīng)分而未分的留存收益。因此，即使合伙企業(yè)對其利潤未做分配，也應(yīng)該按照稅法規(guī)定的分配比例，計算每個合伙人的應(yīng)納稅所得額。（這個是與有限公司不同的地方，有限公司是有分紅才納稅，不分紅不納稅，因為有限公司分紅的那部分是已經(jīng)繳納過企業(yè)所得稅的，而合伙企業(yè)用于分配的利潤還沒有繳納所得稅。）

疑點2：合伙企業(yè)虧損如何處理？

合伙企業(yè)虧損了，是否也可以享受有限公司那種虧損可以稅前彌補的政策，得區(qū)分兩種情形，一個是法人投資者，一個是個人投資者。法人投資者，還是159號文的規(guī)定，合伙企業(yè)的合伙人是法人和其他組織的，合伙人在計算其繳納企業(yè)所得稅時，這部分投資損失是不能當(dāng)時就跨企業(yè)抵扣的，而是要等到這家被投資的合伙企業(yè)以后盈利了，用虧損來抵減盈利，用這種方式來體現(xiàn)當(dāng)時沒有調(diào)整的投資損失。當(dāng)然如果合伙企業(yè)虧損的當(dāng)年就關(guān)門清算了，那法人的股權(quán)投資損失是可以稅前抵扣的。

對于合伙企業(yè)，無論投資者是個人還是法人，適用的政策與一般企業(yè)相同，只是對于法人投資者而言，合伙企業(yè)的虧損不能當(dāng)時跨企業(yè)抵減。